Чрескожная литотрипсия (английское сокращение PCNL) по-прежнему остается предпочтительнее при выборе терапии в случае обнаружения камней в почках диаметром более 2 см, осуществляется через чрескожный прокол диаметром около 1 см в области поясницы, который обеспечивает доступ к почке. Через небольшую трубку под названием "рубашка", диаметром около 1 см, которая помогает поддерживать стабильный путь доступа к почке в течение всей операции, вводится оптический прибор (нефроскоп), внутри которого проходит зонд ультразвука. Зонд способен разрушить камни на кусочки, которые затем отсасываются и / или удаляются с помощью щипцов. Этот метод обеспечивает благоприятный исход, в процентном соотношении приближаясь к 100 %, полностью очищая почку от камней при проведении всего лишь одной процедуры.

Операция проводится под общим наркозом и требует госпитализации от 1 до 3-х суток после операции. Примерно в 10 % случаев могут быть побочные эффекты, такие как серьезные инфекции и кровотечения, и приблизительно в 2 – 4 % этих случаев необходимо проводить переливание крови.